矩阵的计算是并行计算里的一个很重要的问题。矩阵是一种网格化的数据,是一组同类型数值的集合,矩阵的出现,使得代数系统更完善,对各种实际问题的求解产生了巨大的作用。但是其庞大的计算量往往令人生畏,稍微大一点的矩阵,计算就变得非常繁琐,不仅仅是人,而且串行计算的程序,也同样会变得非常缓慢。这时我们就需要并行计算来解决这些问题了。
本文使用分治思想,利用主从节点方式,实现了一个并行计算的矩阵相乘程序,并将结果跟串行程序做了对比,计算了其加速比。
程序设计思路
将一个矩阵按行划分子集,分摊给其他每个节点来计算,每个节点按照行和列的对应关系分别计算一部分结果,然后主节点将每个子节点的计算结果汇总起来。
并行实现 1.cpp
#include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <mpi.h> #include <time.h> #define N 2000 #define FROM_MASTER 1 #define FROM_SLAVE 2 int A[N][N], B[N][N]; unsigned long long C[N][N]; MPI_Status status;//消息接收状态变量,存储也是分布的 int main(int argc, char **argv) { int process_num; //进程数,该变量为各处理器中的同名变量, 存储是分布的 int process_id; int slave_num; int dest; //目的进程标识号 int source; //发送数据进程的标识号 int rows; int row_aver; int remainder; int offset;//行偏移量 int i, j, k; double start_time, end_time; srand((unsigned int)time(NULL)); MPI_Init(&argc, &argv);//初始化MPI /*该函数被各进程各调用一次,得到各自的进程id值*/ MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &process_id); /*该函数被各进程各调用一次,得到进程数*/ MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &process_num); slave_num = process_num - 1; if(process_id == 0) { for (i=0; i<N; i++) { for (j=0; j<N; j++) { A[i][j] = rand() % 10; B[i][j] = rand() % 10; C[i][k] = 0; } } row_aver = N / slave_num; remainder = N % slave_num; offset = 0; double start_time, end_time; double t_duration; clock_t t_start, t_finish; t_start = clock(); //start_time = MPI_Wtime(); //有的程序是将时间函数放在这个for循环的两边 for(dest=1; dest<=slave_num; dest++) { rows = (dest <= remainder) ? row_aver+1 : row_aver; printf("sending %d rows to process %d\n", rows, dest); MPI_Send(&offset, 1, MPI_INT, dest, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD); MPI_Send(&rows, 1, MPI_INT, dest, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD); MPI_Send(&A[offset][0], rows*N, MPI_INT, dest, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD); MPI_Send(&B, N*N, MPI_INT, dest, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD); offset += rows; } for(source=1; source<=slave_num; source++) { MPI_Recv(&offset, 1, MPI_INT, source, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD, &status); //接收行偏移量 MPI_Recv(&rows, 1, MPI_INT, source, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD, &status); //接收行数 MPI_Recv(&C[offset][0], rows*N, MPI_UNSIGNED_LONG_LONG, source, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD, &status); //C接收从进程发回的结果 } //end_time = MPI_Wtime(); t_finish = clock(); t_duration = (double)(t_finish - t_start) / CLOCKS_PER_SEC; printf( "%f seconds\n", t_duration ); //printf("process cost %f seconds\n", end_time-start_time); } if(process_id > 0) { for (i=0; i<N; i++) { for (j=0; j<N; j++) { A[i][j] = 0; B[i][j] = 0; C[i][k] = 0; } } MPI_Recv(&offset, 1, MPI_INT, 0, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD, &status); MPI_Recv(&rows, 1, MPI_INT, 0, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD, &status); MPI_Recv(&A, rows*N, MPI_INT, 0, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD, &status); MPI_Recv(&B, N*N, MPI_INT, 0, FROM_MASTER, MPI_COMM_WORLD, &status); //double start_time, end_time; //start_time = MPI_Wtime(); printf("rows is %d\n",rows); for(i=0; i<rows; i++) { for (k=0; k<N; k++) { int tmp = A[i][k]; for (j=0; j<N; j++) { C[i][j] += tmp*B[k][j]; } } } //end_time = MPI_Wtime(); //printf( "other jiedian compute %f seconds\n", end_time-start_time); MPI_Send(&offset, 1, MPI_INT, 0, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD); //将行偏移量发回主进程 MPI_Send(&rows, 1, MPI_INT, 0, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD); //将行数发回主进程 MPI_Send(&C, rows*N, MPI_UNSIGNED_LONG_LONG, 0, FROM_SLAVE, MPI_COMM_WORLD); //将计算得到的值发回主进程 } printf("process_id %d closed \n",process_id); /*关闭MPI,标志并行代码段的结束*/ MPI_Finalize(); return 0; }
串行实现 0.cpp
#include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <time.h> #define N 2000 int A[N][N], B[N][N]; unsigned long long C[N][N]; int main(int argc, char **argv) { int i, j, k; srand((unsigned int)time(NULL)); for (i=0; i<N; i++) { for (j=0; j<N; j++) { A[i][j] = rand() % 10; B[i][j] = rand() % 10; C[i][k] = 0; } } clock_t t_start, t_finish; t_start = clock(); for (i=0; i<N; i++) { for (k=0; k<N; k++) { for (j=0; j<N; j++) { C[i][j] += A[i][k]*B[k][j]; } } } double t_duration; t_finish = clock(); t_duration = (double)(t_finish - t_start) / CLOCKS_PER_SEC; printf( "%f seconds\n", t_duration ); return 0; }
程序运行结果与分析
启动进程节点数 | 计算任务量 | 时间开销 (s) |
(串行) | 2000*2000 | 33.949744 |
2 | 2000*2000 | 29.764228 |
3 | 2000*2000 | 15.269486 |
5 | 2000*2000 | 7.996483 |
9 | 2000*2000 | 4.173008 |
17 | 2000*2000 | 2.451103 |
33 | 2000*2000 | 1.873135 |
加速比(3) = 2.2234
加速比(5) = 4.2456
加速比(9) = 8.1356
加速比(17) = 13.851
加速比(33) = 18.124
总结
在计算矩阵相乘的时候,我使用的是2000*2000的矩阵来进行计算,计算量是与矩阵的维度成二次方增长的,可以看到,串行时,计算时间很长,而当只有一对主从节点时,从节点计算,主节点汇总,意外发现计算时间竟然比串行程序还稍稍短一点。
从并行的角度看,我们明显可以看出,并行节点数越多,时间开销越小。从每增加2倍节点数时计算的加速比可以看出,随着并行度的提高,加速比逐渐远离理论加速比数值。因为此时,包括节点间通信在内的其他操作造成的时间开销占比变得越来越大,使得每增加2倍节点时产生的加速比效果越来越不明显。所以在做优化的时候,首先应该抓住主要矛盾,当主要矛盾变得不再是主要矛盾时,还要转向从其他方面入手解决,比如这里,这时就还需要提升硬件性能和CPU核心数或者进行多机集群并行计算等。
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“C语言基于MPI并行计算矩阵的乘法”上的2条回复
楼主,感谢你的代码,但是你程序中两处应是 C[i][j] 写成了C[i][k],苦苦debug了好久才发现是这里的错误
不客气~ 你说的这个bug问题我定位一下